Die Mikrobiom-Plattform am Institut für Klinische Molekularbiologie (IKMB) sowie am Institut für Experimentelle Medizin (IEM) vereint korrelative Mikrobiomstudien anhand von Hochdurchsatzsequenzierung mit der funktionalen Charakterisierung mikrobieller Bestandteile. Die hier durchgeführten multi-OMICs-Studien, die mikrobielle Profile, metabolische, genetische, phänotypische und ernährungsbezogene Daten integrieren, werden unter standardisierten Hochdurchsatzmethoden durchgeführt um relevante Faktoren und Mechanismen in Bezug auf die Mikrobiom-Wirts-Interaktion zu identifizieren. Im Detail werden Hochdurchsatzmethoden (Biobanking, Probenvorbereitung, Extraktion von Nukleinsäuren und sequenzierungsbasierte Diversitätsanalysen) mit Ansätzen zur Kultivierung und Ganzgenomsequenzierung zur Identifizierung von Mikroben sowie ihrer metabolischen Fähigkeiten kombiniert. Darüber hinaus wird eine Stammsammlung von mit dem Menschen assoziierten Mikroben aufgebaut. Basierend auf den bisherigen Erkenntnissen sowie dem Gesamtziel der Studien können mithilfe von Bioreaktoren (Infors HT Multifors 2) zusätzlich physiologische Tests durchgeführt werden, um die Wachstumskinetik, die Substratverwertung und die Stoffwechselnebenprodukte einzelner Mikroorganismen unter verschiedenen Bedingungen zu untersuchen.