Genomics-, Transcriptomics-, Proteomics, Metabolomics-Einrichtungen

Die Bandbreite der Dienstleistungen reicht von der Analyse von niedermolelularen Substanzen (Metabolomics) bis zu hochmolekularen Polypeptiden (Proteomics). Für die Analyse von Metaboliten wird der polare Anteil der Probe auf einem GC-TOF-MS vermessen, fragmentiert und mithilfe von Datenbanken annotiert. Unbekannte Bestandteile werden als Unknown mit ausgewertet und können auf Wunsch anhand ihrer Fragmente, Substanzklassen zugeordnet werden. Eine Identifizierung anhand eines Standardabgleiches kann ebenfalls durchgeführt werden. Der unpolare Teil der Probe wird mittels LC-timsTOF-MS/MS analysiert. Auch hier ist eine Strukturaufklärung einzelner Substanzen durch zusätzliche Fragmentierungen möglich. Bei Bedarf kann auch eine Fettsäureanalytik (Lipidomics) durchgeführt werden. Höhermolekulare Biomoleküle / Proteine werden routinemäßig proteolytisch verdaut um Signaturpeptide herzustellen. Diese werden unter Verwendung eines nano-LC-QTOF-MS/MS Systems analysiert. Zur Identifizierung werden Programme wie MaxQuant und ProteinScape verwendet. Die MSBioLMU analysiert standardmäßig diverse Matrizes; von einzelnen Gelbanden oder Gelspots bis hin zu hochkomplexen Zelllysaten oder Zellextrakten.