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BIH / Charité Virtuelle Forschungsumgebung (BIH/Charité VRE)


Die Virtuelle Forschungsumgebung (VRE) ist eine Open-Source-Datenmanagementplattform, die es medizinischen Forschern ermöglicht,
Daten in Übereinstimmung mit der Allgemeinen Datenschutzverordnung der Europäischen Union (EU) zu speichern, zu verarbeiten
und auszutauschen. Die VRE adressiert den gegenwärtigen Mangel an digitalen Forschungsdateninfrastrukturen, die den Bedarf
an (a) Datenschutz für sensible Daten, (b) Fähigkeit zur Verarbeitung komplexer Daten wie z.B. radiologischer Bildgebung,
(c) Flexibilität zur Erstellung eigener Verarbeitungsabläufe, (d) Zugang zu Hochleistungsrechnern erfüllen. Die Plattform
fördert die FAIR-Datengrundsätze und baut Hindernisse für die biomedizinische Forschung und Innovation ab. Die VRE basiert
auf einem modularen und erweiterbaren State-of-the-Art-Cloud-Computing-Framework, einer RESTful-API, offenen Entwicklertreffen,
Hackathons und einer umfassenden Dokumentation für Nutzer, Entwickler und Administratoren. Die VRE mit ihren konzertierten
technischen und organisatorischen Maßnahmen kann von anderen Forschungsgemeinschaften übernommen werden und ermöglicht so
die Entwicklung eines sich gemeinsam entwickelnden interoperablen Plattform-Ökosystems mit einer aktiven Forschungsgemeinschaft.
Adresse: Robert-Koch-Platz 4
10115 Berlin
Berlin
Deutschland
Zur Webseite
10115 Berlin
Berlin
Deutschland
Zur Webseite
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Träger
Charité Universitätsmedizin Berlin
Charitéplatz 1
10115 Berlin
Berlin
Deutschland
https://www.charite.de/
Charitéplatz 1
10115 Berlin
Berlin
Deutschland
https://www.charite.de/
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Wissenschaftsgebiet
Hauptgebiete:
- Medizin
Nebengebiete:
- Biologie
- Mathematik
- Elektrotechnik, Informatik und Systemtechnik
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Kategorie
Virtuelle Forschungsumgebungen
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Wissenschaftliche Dienstleistungen
Die VRE bietet ein Webportal mit grafischen und Befehlszeilen-Schnittstellen, getrennte Datenzonen und organisatorische Maßnahmen
für die rechtmäßige Datenübernahme, isolierte Rechenumgebungen, in denen große Teams gemeinsam und privat sensible Daten verarbeiten
können, Analyse-Workbench-Tools für die Verarbeitung, Analyse und Visualisierung großer Datenmengen, automatisierte Aufnahme
von Krankenhausdatenquellen, projektspezifische Data Warehouses für die strukturierte Speicherung und Abfrage, Graphdatenbanken
für die Erfassung und Abfrage ontologiebasierter Metadaten, Provenance-Tracking, Versionskontrolle und Unterstützung für die
automatische Datenextraktion und -indizierung.
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Wissenschaftliche Geräte
- Virtuelle Forschungsumgebung
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Schlagworte
- Gesundheitsdaten
- Datenschutzgrundverordnung
- sensible Daten
- Datenschutz
- Jupyter workbench
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Netzwerke
European Open Science Cloud
https://eosc-portal.eu/
https://eosc-portal.eu/
EBRAINS Forschungsinfrastruktur
https://ebrains.eu/
https://ebrains.eu/
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Nutzer/Jahr
Interne Nutzer: 60
Externe Nutzer gesamt: 60
Externe Nutzer in Deutschland: 30
Externe Nutzer im europ. Ausland: 20
Externe Nutzer außerhalb Europas: 10