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Kernfazilität zur Probenvorbereitung und Charakterisierung (SPC)
Die SPC-Core Facility des EMBL Hamburg bietet eine Pipeline 'vom Labortisch zu den Beamlines am
Synchrotron', die Ihnen hilft,
Proben für die Strukturanalyse zu optimieren und vorzubereiten. Unser
Hochdurchsatz-Kristallisationslabor bietet sowohl initiale
Kristallisationsscreens als auch
kundenspezifische Screens zur Optimierung der initialen Treffer, sowohl für lösliche Proteine
als auch
für Membranproteine. Die Überprüfung der Platten ist online über das Crystallization Information
Management System
(CRIMS) möglich, das den Benutzern die Ergebnisse in Echtzeit zusammen mit
allen experimentellen Parametern des Kristallisationszustandes
zur Verfügung stellt. Die Integration
von Kristallisations- und Synchrotron-Datenerfassungseinrichtungen kann durch automatisierte
Kristallextraktion
und -verarbeitung realisiert werden. Darüber hinaus bieten wir Unterstützung bei der
Durchführung von Kleinwinkel-Röntgenstreung-Messungen
(SAXS) mit zeitnaher Ausgaben von
makromolekularen Strukturparametern und niedrig aufgelösten Molekularstrukturen. Die
biophysikalische
Plattform des SPC umfasst modernste Technologien zur Messung von
Wechselwirkungen und zur präzisen Bestimmung der Stabilität,
Form und Größe verschiedener
Biomoleküle und biomolekularer Komplexe. Dies erlaubt es Forschern, die am besten geeigneten
biophysikalischen
Techniken zur Beantwortung molekularbiologischer Fragestellungen zu ermitteln
und anzuwenden.
Adresse: Notkestraße 85, Gebäude 25a
22607 Hamburg
Hamburg
Deutschland
Zur Webseite
22607 Hamburg
Hamburg
Deutschland
Zur Webseite
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Träger
European Molecular Biology Laboratory (EMBL)
Notkestraße 85, Gebäude 25a
22607 Hamburg
Hamburg
Deutschland
http://www.embl-hamburg.de/services/spc/index.html
Notkestraße 85, Gebäude 25a
22607 Hamburg
Hamburg
Deutschland
http://www.embl-hamburg.de/services/spc/index.html
Centre for Structural Systems Biology (CSSB)
Notkestraße 85, Gebäude 15
22607 Hamburg
Hamburg
Deutschland
https://www.cssb-hamburg.de/facilities/index_eng.html
Notkestraße 85, Gebäude 15
22607 Hamburg
Hamburg
Deutschland
https://www.cssb-hamburg.de/facilities/index_eng.html
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Wissenschaftsgebiet
Hauptgebiete:
- Biologie
Nebengebiete:
- Chemie
- Physik
-
Kategorie
Systembiologie-Einrichtungen
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Wissenschaftliche Dienstleistungen
Das EMBL Hamburg hat eine vollautomatisierte Plattform für die Hochdurchsatz-Kristallisation von
biologischen Makromolekülen
eingerichtet, um einen gängigen Engpass in der
Röntgenkristallographie zu beheben. Die SPC-Kristallisationsplattform bietet
eine breite Palette von
Kristallisationsscreening-Bedingungen, und es wurden flexible Methoden entwickelt, um jeden Schritt
an
die individuellen Projektanforderung anzupassen. Die Dienste stehen der allgemeinen
Benutzergemeinschaft zur Verfügung. Unsere
Kristallisationsplattform unterstützt sowohl die
Nanotropfenkristallisation als auch die lipidische kubische Phase (LCP) Kristallisation.
Alle Platten
können in einem unserer Rockimaker 1000-Imager (bei 4º oder 19 ºC) visuell überprüft werden. Auf
die Bilder kann
über CRIMS extern zugegriffen werden. Die Anlage ist mit zwei Pipettierrobotern
(Mosquito-LCP) ausgestattet. Kundenspezifische
Kristallisationsscreens können mit automatisierten
Dosierrobotern formuliert werden. Darüber hinaus bietet unsere Plattform
für molekulare Biophysik
eines der am besten ausgestatteten biophysikalischen Labors in Europa. Wir unterstützen die
Benutzer
bei der Planung, Durchführung und Datenanalyse von biophysikalischen Experimenten zur
Charakterisierung von Proteinen, Proteinkomplexen
und von Interaktionen zwischen Proteinen und
anderen Molekülen. Die Charakterisierung dieser Strukturen wird durch die Untersuchung
von
Parametern wie Stabilität, Form, Faltungszustand, Aggregationstendenz, Homogenität und
Oligomerisationsustand analysiert.
Die Wechselwirkungen, an denen sie beteiligt sind, können durch
die Messung biophysikalischer Kriterien wie Spezifität, Kinetik,
Affinität und Thermodynamik verfolgt
werden.
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Wissenschaftliche Geräte
- Mosquito LCP crystallization robots and online follow
- CrystalDirect Automatic crystal harvester
- Scorpion Screen Formulator and Biomek automated
- Microcal VP-ITC and PEAQ-ITC
- Microscale Thermophoresis Labelled and Label Free
- nano Differential Scattering Fluorescence (nDSF)
- Circular Dichroism spectrophotometer
- Bruker Vertex 70 Fourier-transform infrared spectrophometer
- MALDI-TOF with High Mass detector
- Biolayer Interferometry Octet RED96
- SX-20 Stopped-Flow spectrophometer
- Dynamic Light Scattering (DLS)
- SPR T200 (Biacore)
- SAXS-batch mode
- Molecular Dynamics simulations
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Schlagworte
- Strukturbiologie
- Molekulare Biophysik
- Kristallisation
- Stabilität
- Homogenität
- Thermodynamik
- Kinetik
- Struktur und Funktion
- Protein-Interaktionen
- Streuung
- Bindung
- Komplexe
- Aggregation
- Faltung und Entfaltung von Proteinen
- Datenanalyse
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Netzwerke
iNEXT- Discovery
https://inext-discovery.eu/network/inext-d/home
https://inext-discovery.eu/network/inext-d/home
Instruct-ERIC
https://instruct-eric.eu/
https://instruct-eric.eu/
Vereinigung von Ressourcen für biophysikalische Forschung in Europa (ARBRE-MOBIEU)
https://arbre-mobieu.eu/
https://arbre-mobieu.eu/
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Nutzer/Jahr
Interne Nutzer: 57 (2019)
Externe Nutzer gesamt: 177 (2019)
Externe Nutzer in Deutschland: 112 (2019)
Externe Nutzer im europ. Ausland: 67 (2019)
Externe Nutzer außerhalb Europas: 55 (2019)